教育部十分重视特区大学的创办，选派原大学副校长、两院院士张维出任首任校长，从大学、大学等国内名校抽调一批名师担任系主任。学校积极开展高校内部1995年通过国家首批本科教学合格评价，1996年经国务院学位委员会批准成为硕士学位授予单位。1997年实行学院制，明确了以本科教育为主、积极发展研究生教育的办学思。2000年确立了从单纯教学型向教学与科研并重型转变的办学目标。2005年经批准成为工程专业硕士授权单位，新增2个工程专业硕士培养领域。2006年1月经国务院学位委员会批准为博士学位授予单位，形成了从学士、硕士到博士的完才培养体系。
建校以来，广泛关注。同志曾要办好深圳大学，题写校名，、万里、、、陈至立等先后来校视察。总统玛丽麦卡利斯、日本国原总理大臣海部俊树、科学家杨振宁、王大珩、王淦昌等受聘名誉教授。知名人士于元平、胡应湘、邵逸夫、梁国勋等捐资助学。国内知名创业者本校毕业生深圳腾迅公司马化腾、江苏红豆公司周海江、深圳西部创业中心邓亦群、深圳海岸地产李亦标，知名企业家、南太集团顾明均等设立专项学金。十八家深圳大型国有企业为校董事单位。
学校设有14个学院（含省级软件示范学院）。现拥有文学、理学、工学、经济学、管理学、和教育学等8个学科门类的本科专业54个，硕士学位一级学科点3个、二级学科点66个，工程专业硕士培养领域2个，博士学位学科点3个（其中一级学科点1个）；全日制在校本科生16741名，全日制在校硕士研究生1245名，博士研究生（联合培养）14名，外国留学生920名，中外合作办学学生514名，学历教育学生18000人。
学校师资队伍年龄结构合理，高学历、多元化并具有国际性背景。现有教学科研人员1102名，其中，正高职称教师225名，副高职称教师498名，有博士学位的374名，有硕士学位的469名。拥有中国工程院院士1名，双聘院士6名，博士生导师37名，国家级有突出贡献专家3名，国务院特殊津贴专家29名，教育部各学科教学指导委员会委员9名。
学校建有理工类重点实验室7个：教育部/广东省光电子器件与系统重点实验室、ATR国防科技重点实验室智能信息处理研究室、深圳市现代通信与信息处理重点实验室、 深圳市激光工程重点实验室、深圳市微生物基因工程重点实验室、深圳市特种功能材料重点实验室、深圳市土木工程耐久性重点实验室；人文社科重点研究4个：深圳大学中国经济特区研究中心、深圳大学当代中国研究所、深圳大学传媒与文化发展研究中心、深圳现代艺术与设计研究中心。有光学工程、信号与信息处理、细胞生物学、文艺学、行政管理、材料物理与化学、通信与信息系统、建筑设计及其理论、经济学、国际等10个省级重点学科，电子信息工程、建筑学、金融学等7 个广东省名牌专业。近5年发表论文5713篇，其中被SCI、EI、ISTP收录414篇，被CSSCI收录813篇；出版专著356部、译著35部。获得国家技术发明二等、广东省技术发明一等、解放军科技进步二等等省部级以上科研26项；转让科研48项，被采纳科研281项。在六届“高交会”上签约总额超过6亿元。“十五”期间承担科研项目617项，其中“863”、“973”、国家自然科学基金、国家社会科学基金等项目108项，国防科研项目13项。2005年实到科研经费总计6100万元。
学校充分利用区位优势，积极开展对外交流合作。为港澳台培养各类人才2000余名。与英国等国外高校开展双校园合作培养本科生，累计已超过2500名，培养质量得到英国国家文化委员会的优秀评价。与英美日韩多所大学结成姐妹学校，每年互派教师、学生。现有来自40多个国家的920名留学生。星期二左眼跳